단순한 숫자로 보이는 GPA에도 여러 복잡한 요소가 작용한다. 대학들은 학교별 다양한 평가 체계, 성적 인플레이션 경향, 수업 난이도 등을 종합적으로 고려한다. 많은 입시생이 자신의 GPA를 다른 학교 학생과 비교하려 하지만 이는 잘못된 접근이다. 같은 3.8이라는 숫자라도 그 의미는 학교마다 완전히 다를 수 있다. GPA는 개별 학생이 속한 학교 내 학업 성취를 반영하는 지표로 학교마다 제공하는 AP, IB, Honors 수업의 종류와 난이도, 점수 가중치가 달라 단순 비교가 어렵다.
예를 들어 A 학교는 15개의 AP 과목을 제공하고 가중치를 5.0까지 부여하는 반면, B 학교는 5개의 AP 과목만 제공하고 가중치도 4.5까지만 인정한다면 두 학교 학생의 GPA를 동일 선상에서 비교하는 것은 공정하지 않다.